در ســال 1358 درمانگاه قدیم پس از 34 سال فعالیت تخریب و ساختمان چشم پزشکی به نام امام علی ابن ابیطالب(ع) در چهار طبقه در سال 1360 افتتاح و به مجموعه قبلی ملحق شد. در سال 1387در جوار بیمارستان ساختمان جدید الاحداث کلینیک تخصصی و فوق‌تخصصی امام علی ابن ابیطالب(ع) افتتاح شد.
کلینیک فوق تخصصی چشــم روزانه تعداد زیادی مراجعه کننده دارد و مراجعین از نقاط مختلف استان اصفهان و استان‌های هم‌جوار بــه این مرکز مراجعه و تحت معاینات و خدمات چشــم پزشــکی قرار می‌گیرند و این تعداد با شــروع برنامه تحول نظام ســلامت هــر روز رو به افزایش است و کلیه لــوازم مصرفی بیماران از قبیــل لنزهای داخل چشــمی، دارو و تجهیزات و … به عهده بیمارســتان است و ارجاع بیماران جهت تهیه آنها به خارج از مرکز ممنوع است.
